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PCR步驟及循環(huán)參數(shù)
點擊次數(shù):3077 更新時間:2021-10-08
  PCR步驟:1.  DNA變性
 
  (90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下, 氫鍵斷裂,形成單鏈DNA。
 
  2.  退火
 
  (25℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。
 
  3.  延伸
 
  (70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP為原料,從引物的5′端→3′端延伸,合成與模板互補的DNA鏈
 
  PCR的循環(huán)參數(shù):
 
  1.  預變性(Initial denaturation)
 
  模板DNA*變性與PCR酶的*激活對PCR能否成功至關(guān)重要,建議加熱時間參考試劑說明書,一般未修飾的Taq酶激活時間為兩分鐘。
 
  2.  循環(huán)中的變性步驟
 
  循環(huán)中一般95℃,30秒足以使各種靶DNA序列*變性,可能的情況下可 縮短該步驟時間,變性時間過長損害酶活性,過短靶序列變性不*,易造成擴增失敗。
 
  3.  引物退火(Primer annealing)
 
  退火溫度需要從多方面去決定,一般根據(jù)引物的Tm值為參考,根據(jù)擴增的長度適當下調(diào)作為退火溫度。然后在此次實驗基礎(chǔ)上做出預估。
 
  退火溫度對PCR的特異性有較大影響。
 
  4.  引物延伸
 
  引物延伸一般在72℃進行(Taq酶最適溫度)。但在擴增長度較短且退火溫度較高時,本步驟可省略
 
  延伸時間隨擴增片段長短而定,一般推薦在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生設定為1 min/kbp。
 
  5.  循環(huán)數(shù)
 
  大多數(shù)PCR含25-40循環(huán),過多易產(chǎn)生非特異擴增。
 
  6.  最后延伸
 
  在最后一個循環(huán)后,反應在72℃維持5-15分鐘.使引物延伸*,并使單鏈產(chǎn)物退火成雙鏈。
 
  
 
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